RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537954.5

PGA3-203, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2

Gene PGA3, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-203ENST00000537954 CHD4Q14839 1912 aa22.49■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 CYP27B1O15528 508 aa22.48■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 KLHL34Q8N239 644 aa22.48■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.48■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
PGA3-203ENST00000537954 MSH5O43196 834 aa22.45■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.45■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.44■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 SPG7Q9UQ90 795 aa22.44■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.43■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.43■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 PALLDQ8WX93 1383 aa22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 PHKG2P15735 406 aa22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.42■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 C1QTNF8P60827 252 aa22.41■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.41■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 MSL1Q68DK7 614 aa22.4■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 PIGBQ92521 554 aa22.4■■□□□ 1.18
PGA3-203ENST00000537954 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 GRIN3BO60391 1043 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 RUNDC1Q96C34 613 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 C5P01031 1676 aa22.37■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.37■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.37■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 ITGB4P16144 1822 aa22.36■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.36■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.36■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 NFE2L2Q16236 605 aa22.35■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.34■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.33■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.33■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 AK7Q96M32 723 aa22.33■■□□□ 1.17
PGA3-203ENST00000537954 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 LGR6Q9HBX8 967 aa22.32■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 MRC1P22897 1456 aa22.32■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 C4BP0C0L5 1744 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 APAF1O14727 1248 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 SIK1P57059 783 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 SMIM5Q71RC9 77 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 IL17REQ8NFR9 667 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 DCAF5Q96JK2 942 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.3■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.29■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 SSFA2P28290 1259 aa22.29■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.29■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 CEP350Q5VT06 3117 aa22.29■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 PHF14O94880 888 aa22.28■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 DCTN1Q14203 1278 aa22.28■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.28■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 NEFMP07197 916 aa22.27■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 ITPK1Q13572 414 aa22.27■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 MCM10Q7L590 875 aa22.27■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 ATG3Q9NT62 314 aa22.27■■□□□ 1.16
PGA3-203ENST00000537954 RIPK4P57078 832 aa22.26■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.25■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.25■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 ATP6V1AP38606 617 aa22.24■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 NEUROD2Q15784 382 aa22.24■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.23■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 GNPATO15228 680 aa22.21■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.21■■□□□ 1.15
PGA3-203ENST00000537954 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.2■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 ATP10DQ9P241 1426 aa22.2■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 CABP4P57796 275 aa22.19■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 ADCY9O60503 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.17■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.17■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 CCDC27Q2M243 656 aa22.16■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.16■■□□□ 1.14
PGA3-203ENST00000537954 MMP10P09238 476 aa22.15■■□□□ 1.14
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