RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MCM4P33991 863 aa21.28■■□□□ 1
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.28■■□□□ 1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 HSCBQ8IWL3 235 aa21.28■■□□□ 1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.28■■□□□ 1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.28■■□□□ 1
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.11■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.09■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 COL18A1P39060 1754 aa21.09■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.09■□□□□ 0.97
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MEGF6O75095 1541 aa21.08■□□□□ 0.97
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