RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PROC	P04070	461 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SSFA2	P28290	1259 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	UPP2	O95045	317 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	EML3	Q32P44	896 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	DPYD	Q12882	1025 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920		Q8N3U1	123 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23	5e-7	■■■□□ 16.1
MED17-208	ENST00000531920	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SCNN1A	P37088	669 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SERPINB4	P48594	390 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CLDN10	P78369	228 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ZBTB33	Q86T24	672 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ARID5B	Q14865	1188 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ITGA6	P23229	1130 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	PRMT3	O60678	531 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	IGSF3	O75054	1194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MED17-208	ENST00000531920		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	LGR5	O75473	907 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	GTF2I	P78347	998 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	SPINT1	O43278	529 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	DKK1	O94907	266 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	ABL1	P00519	1130 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	SEC13	P55735	322 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	PSME1	Q06323	249 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	SIX5	Q8N196	739 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	GAS6	Q14393	721 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MED17-208	ENST00000531920	ERFE	Q4G0M1	354 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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