RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 SLC35F4A4IF30 521 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 POU4F2Q12837 409 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 IRF7Q92985 503 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 NACADO15069 1562 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 GNASQ5JWF2 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF15Q8N660 670 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 OGFOD1Q8N543 542 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 CLDN10P78369 228 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 BACH1O14867 736 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ITGA6P23229 1130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SMTNP53814 917 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF358Q9NW07 568 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 RASA1P20936 1047 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 PHKA2P46019 1235 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 WDR44Q5JSH3 913 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC102BQ68D86 513 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ERBB4Q15303 1308 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 CDC14CA4D256 554 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ARID3CA6NKF2 412 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 A6NJY4 79 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 C4orf17Q53FE4 359 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 LCE2CQ5TA81 110 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 RFX1P22670 979 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 VSIG8P0DPA2 414 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 SIX5Q8N196 739 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-214ENST00000530727 GMPRP36959 345 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G4AP47712 749 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 MTFR1Q15390 333 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GTH6 734 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CDK2AP1O14519 115 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SV2AQ7L0J3 742 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L15C9J2P7 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L10C9JJH3 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L12C9JPN9 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L11C9JVI0 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L21D6R901 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L18D6R9N7 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L22D6RA61 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L19D6RCP7 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L20D6RJB6 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L24Q0WX57 530 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 TNS4Q8IZW8 715 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 GPAMQ9HCL2 828 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CABP1Q9NZU7 370 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 FAM196BA6NMK8 535 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SFI1A8K8P3 1242 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 H7C1W4 665 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 F11P03951 625 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CDCA8Q53HL2 280 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 USP3Q9Y6I4 520 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SEC13P55735 322 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 PTK7Q13308 1070 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.06□□□□□ -1.28
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