RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.94□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 RGS12O14924 1447 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 BTBD11A6QL63 1104 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 STK31Q9BXU1 1019 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 MRC1P22897 1456 aa14.93□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 SLC4A2P04920 1241 aa14.92□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 IGHDP01880 384 aa14.91□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 DCAF5Q96JK2 942 aa14.91□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 CYP27B1O15528 508 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 EVA1CP58658 441 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 IL2RBP14784 551 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 STRN4Q9NRL3 753 aa14.9□□□□□ -0.02
USP17L3-201ENST00000530484 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 BTG4Q9NY30 223 aa14.89□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.89□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 KCNQ3O43525 872 aa14.88□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.88□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.88□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 FLIIQ13045 1269 aa14.86□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 G2E3Q7L622 706 aa14.86□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 PIP4K2BP78356 416 aa14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF790Q6PG37 636 aa14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.85□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 NRAPQ86VF7 1730 aa14.84□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.84□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 DISP2A7MBM2 1401 aa14.83□□□□□ -0.03
USP17L3-201ENST00000530484 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.83□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 NECTIN2Q92692 538 aa14.83□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.83□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 CABP4P57796 275 aa14.82□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 C5P01031 1676 aa14.82□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SKAP1Q86WV1 359 aa14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SMC5Q8IY18 1101 aa14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 PAPPAQ13219 1627 aa14.81□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 F6X3S4 739 aa14.8□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SLC39A6Q13433 755 aa14.8□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.8□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 USP35Q9P2H5 1018 aa14.8□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 GLI3P10071 1580 aa14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 ADAMTS2O95450 1211 aa14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.79□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SLIT2O94813 1529 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 LRP6O75581 1613 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 JCADQ9P266 1359 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 ATP10DQ9P241 1426 aa14.78□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 RGS3P49796 1198 aa14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 HYPKQ9NX55 129 aa14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
USP17L3-201ENST00000530484 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.77□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.77□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 GCC1Q96CN9 775 aa14.77□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 MEIS3Q99687 375 aa14.77□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 TNS2Q63HR2 1409 aa14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 CERKQ8TCT0 537 aa14.76□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 GNAI3P08754 354 aa14.75□□□□□ -0.05
USP17L3-201ENST00000530484 PDE4AP27815 886 aa14.75□□□□□ -0.05
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