RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.71■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 DCAF5Q96JK2 942 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 AK7Q96M32 723 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.7■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 MSH5O43196 834 aa25.69■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.69■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.69■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 TJP1Q07157 1748 aa25.68■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 C4AP0C0L4 1744 aa25.67■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 MTHFSP49914 203 aa25.67■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 SSFA2P28290 1259 aa25.66■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 KLHL34Q8N239 644 aa25.66■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 MRC1P22897 1456 aa25.66■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 ATP6V1AP38606 617 aa25.65■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 PHF14O94880 888 aa25.64■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTTN-211ENST00000527622 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.63■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 GNPATO15228 680 aa25.61■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.6■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.6■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 CABP4P57796 275 aa25.58■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 GPR162Q16538 588 aa25.58■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.58■■□□□ 1.69
CTTN-211ENST00000527622 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.57■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.57■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 HMOX1P09601 288 aa25.56■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.55■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.55■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.54■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 LGR6Q9HBX8 967 aa25.52■■□□□ 1.68
CTTN-211ENST00000527622 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.5■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 RPS6KA4O75676 772 aa25.49■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 ADRA2BP18089 450 aa25.49■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.47■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.46■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 MMP10P09238 476 aa25.46■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.46■■□□□ 1.67
CTTN-211ENST00000527622 GYS1P13807 737 aa25.45■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 GRIN3BO60391 1043 aa25.44■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 SLC39A6Q13433 755 aa25.43■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.41■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.41■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 RFC4P35249 363 aa25.39■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTTN-211ENST00000527622 ADCY9O60503 1353 aa25.39■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 PPP2R1AP30153 589 aa25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 IL17REQ8NFR9 667 aa25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.37■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.36■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.36■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.36■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.36■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 FKBP8Q14318 412 aa25.35■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.35■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 DDR1Q08345 913 aa25.34■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.34■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.33■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.33■■□□□ 1.65
CTTN-211ENST00000527622 ATP10DQ9P241 1426 aa25.32■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.32■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 PRKAR2BP31323 418 aa25.32■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 SCN7AQ01118 1682 aa25.32■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 COL15A1P39059 1388 aa25.31■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.31■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 CFAP53Q96M91 514 aa25.31■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 TGFB2P61812 414 aa25.3■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.3■■□□□ 1.64
CTTN-211ENST00000527622 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms