RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527449.1

RBM25-206, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 1 (best)

Gene RBM25, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-206	ENST00000527449	USP6	P35125	1406 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	ITGB4	P16144	1822 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	TMF1	P82094	1093 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	COL15A1	P39059	1388 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	MYH7	P12883	1935 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PXDN	Q92626	1479 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	MET	P08581	1390 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PDE4C	Q08493	712 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PANK3	Q9H999	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	MYH3	P11055	1940 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	ABCC4	O15439	1325 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	LY75	O60449	1722 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RBM25-206	ENST00000527449	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	PTPRE	P23469	700 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	SOCS7	O14512	581 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ITGAE	P38570	1179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	MSH6	P52701	1360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	FGD1	P98174	961 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449		E9PSI1	815 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	NEFL	P07196	543 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	IDI1	Q13907	227 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	LAMB1	P07942	1786 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	TNR	Q92752	1358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	IL13	P35225	146 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM25-206	ENST00000527449	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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