RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, human

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW11-208	ENST00000520376	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	SIK1	P57059	783 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	RALBP1	Q15311	655 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	TJP1	Q07157	1748 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	ITPK1	Q13572	414 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	PTGER2	P43116	358 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	AK7	Q96M32	723 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	FCHSD2	O94868	740 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXW11-208	ENST00000520376	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	MSH5	O43196	834 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FBXW11-208	ENST00000520376	GNPAT	O15228	680 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	PHF14	O94880	888 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	SSFA2	P28290	1259 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	TEF	Q10587	303 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	POLD1	P28340	1107 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	NEFM	P07197	916 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	ARX	Q96QS3	562 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	MCM10	Q7L590	875 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXW11-208	ENST00000520376	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	ADRA2B	P18089	450 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
FBXW11-208	ENST00000520376	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.06	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	KCNQ3	O43525	872 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	RFC4	P35249	363 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXW11-208	ENST00000520376	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	COL15A1	P39059	1388 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	STARD3NL	O95772	234 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXW11-208	ENST00000520376	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms