RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 POLD1P28340 1107 aa26.95■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.95■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.94■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 ATXN8OSP0DMR3 200 aa26.94■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.93■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 EYA1Q99502 592 aa26.93■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 PALLDQ8WX93 1383 aa26.92■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 MAP3K5Q99683 1374 aa26.92■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
USP53-208ENST00000514305 KLHL34Q8N239 644 aa26.88■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 CHD4Q14839 1912 aa26.86■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 IL13P35225 146 aa26.85■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.84■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.84■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 PIGBQ92521 554 aa26.84■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 C4BP0C0L5 1744 aa26.84■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.83■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.83■■□□□ 1.89
USP53-208ENST00000514305 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 PHKG2P15735 406 aa26.81■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.81■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 AK7Q96M32 723 aa26.8■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 GPR162Q16538 588 aa26.79■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 MRS2Q9HD23 443 aa26.78■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.78■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 NEFMP07197 916 aa26.77■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 UTRNP46939 3433 aa26.77■■□□□ 1.88
USP53-208ENST00000514305 CCER2I3L3R5 266 aa26.76■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 MSL1Q68DK7 614 aa26.76■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.75■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 SIK1P57059 783 aa26.75■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.75■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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USP53-208ENST00000514305 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.73■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 FCHSD2O94868 740 aa26.72■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 PHF14O94880 888 aa26.71■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.71■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.71■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 DCAF5Q96JK2 942 aa26.71■■□□□ 1.87
USP53-208ENST00000514305 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.7■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 ATP6V1AP38606 617 aa26.7■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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USP53-208ENST00000514305 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.69■■□□□ 1.86
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USP53-208ENST00000514305 KDRP35968 1356 aa26.69■■□□□ 1.86
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USP53-208ENST00000514305 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.67■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.66■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 MIER1Q8N108 512 aa26.66■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 GNPATO15228 680 aa26.65■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 ITPK1Q13572 414 aa26.65■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.65■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.65■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 CABP4P57796 275 aa26.64■■□□□ 1.86
USP53-208ENST00000514305 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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USP53-208ENST00000514305 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
USP53-208ENST00000514305 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.62■■□□□ 1.85
USP53-208ENST00000514305 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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USP53-208ENST00000514305 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.61■■□□□ 1.85
USP53-208ENST00000514305 CCDC184Q52MB2 194 aa26.6■■□□□ 1.85
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USP53-208ENST00000514305 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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USP53-208ENST00000514305 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.59■■□□□ 1.85
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USP53-208ENST00000514305 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
USP53-208ENST00000514305 RUNDC1Q96C34 613 aa26.56■■□□□ 1.84
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USP53-208ENST00000514305 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.55■■□□□ 1.84
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USP53-208ENST00000514305 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.54■■□□□ 1.84
USP53-208ENST00000514305 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.53■■□□□ 1.84
USP53-208ENST00000514305 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.53■■□□□ 1.84
USP53-208ENST00000514305 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
USP53-208ENST00000514305 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.51■■□□□ 1.83
USP53-208ENST00000514305 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
USP53-208ENST00000514305 C4AP0C0L4 1744 aa26.5■■□□□ 1.83
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