RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513985.5

ZNF608-208, Transcript of zinc finger protein 608, human

TSL 1 (best)

Gene ZNF608, Length 1,539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF608-208	ENST00000513985	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	AMPH	P49418	695 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	PDE4D	Q08499	809 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	HAX1	O00165	279 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	SOCS7	O14512	581 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ZNF608-208	ENST00000513985	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	MEGF6	O75095	1541 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	EVX2	Q03828	476 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	BCL9	O00512	1426 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	MAP3K13	O43283	966 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	MTHFS	P49914	203 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	EYA1	Q99502	592 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	IL2RB	P14784	551 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	IL13	P35225	146 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNF608-208	ENST00000513985	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	KDR	P35968	1356 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	ARID3A	Q99856	593 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	DDB1	Q16531	1140 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985		A0A0G2JS52	829 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	MYT1	Q01538	1121 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	EXOC5	O00471	708 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	RALBP1	Q15311	655 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	GPR37	O15354	613 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
ZNF608-208	ENST00000513985	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	CYP27B1	O15528	508 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PDIA6	Q15084	440 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DPYSL4	O14531	572 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	TRIM37	O94972	964 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	KCNQ2	O43526	872 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	HMOX1	P09601	288 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	PHKG2	P15735	406 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	FLII	Q13045	1269 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF608-208	ENST00000513985	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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