RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HMOX1P09601 288 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITPK1Q13572 414 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 YY1P25490 414 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSL1Q68DK7 614 aa20.39■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP53Q96M91 514 aa20.38■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.35■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP2R1AP30153 589 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.3■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 RFC4P35249 363 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.23■□□□□ 0.83
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.22■□□□□ 0.83
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.19■□□□□ 0.82
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZPR1O75312 459 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TJP1Q07157 1748 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHD4Q14839 1912 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEFMP07197 916 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BTBD11A6QL63 1104 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP8Q14318 412 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RALBP1Q15311 655 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NARFQ9UHQ1 456 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TM4SF1P30408 202 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.11■□□□□ 0.81
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