RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSL1Q68DK7 614 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00116Q8NCU8 138 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHF14O94880 888 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMOX1P09601 288 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YY1P25490 414 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K5Q99683 1374 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITPK1Q13572 414 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM5Q71RC9 77 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNPATO15228 680 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKAP4Q5JQC9 854 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSFA2P28290 1259 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A9Q96Q91 983 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR162Q16538 588 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCN11AQ9UI33 1791 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGR6Q9HBX8 967 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF831Q5JPB2 1677 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP53Q96M91 514 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNMTO43148 476 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAPPC3LQ5T215 181 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC52A2Q9HAB3 445 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD2APQ9Y5K6 639 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS6KA4O75676 772 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP2R1AP30153 589 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD4Q14839 1912 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADRA2BP18089 450 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDCQ9Y266 331 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFC4P35249 363 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRKLP46109 303 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC39A6Q13433 755 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAS2L2Q8NHY3 880 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRC1P22897 1456 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.26■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.25■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP10P09238 476 aa31.25■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TJP1Q07157 1748 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC10Q8IXB1 793 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKAR2BP31323 418 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP31.23■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UTRNP46939 3433 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN3BO60391 1043 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEFQ10587 303 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPH6AQ9H0K4 717 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GYS1P13807 737 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL17REQ8NFR9 667 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHACTR3Q96KR7 559 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC5Q8N0Z6 440 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC87Q9NVE4 849 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C4AP0C0L4 1744 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCPQ6ZWJ8 1503 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VSIG10Q8N0Z9 540 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCHSD2O94868 740 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZPR1O75312 459 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FKBP8Q14318 412 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF790Q6PG37 636 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STARD3NLO95772 234 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTBD11A6QL63 1104 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGFB2P61812 414 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF13BQ9NQT8 1826 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HEG1Q9ULI3 1381 aa31.05■■■□□ 2.56
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