RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARXQ96QS3 562 aa25.83■■□□□ 1.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 CABP4P57796 275 aa25.82■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.82■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.82■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP6V1AP38606 617 aa25.8■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP53Q96M91 514 aa25.8■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATG3Q9NT62 314 aa25.8■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 KLHL34Q8N239 644 aa25.79■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.79■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHF14O94880 888 aa25.77■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.77■■□□□ 1.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.76■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 SYT17Q9BSW7 474 aa25.75■■□□□ 1.71
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USP46-AS1-201ENST00000503051 MSL1Q68DK7 614 aa25.74■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAP3K5Q99683 1374 aa25.73■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 ITPK1Q13572 414 aa25.73■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 RALBP1Q15311 655 aa25.73■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRC1P22897 1456 aa25.72■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.72■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNPATO15228 680 aa25.72■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 TJP1Q07157 1748 aa25.71■■□□□ 1.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHD4Q14839 1912 aa25.71■■□□□ 1.71
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USP46-AS1-201ENST00000503051 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.71■■□□□ 1.71
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USP46-AS1-201ENST00000503051 NUDCQ9Y266 331 aa25.69■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 C4AP0C0L4 1744 aa25.68■■□□□ 1.7
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USP46-AS1-201ENST00000503051 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.67■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.67■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMIM5Q71RC9 77 aa25.66■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.66■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGR6Q9HBX8 967 aa25.65■■□□□ 1.7
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USP46-AS1-201ENST00000503051 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.64■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.64■■□□□ 1.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.63■■□□□ 1.69
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USP46-AS1-201ENST00000503051 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
USP46-AS1-201ENST00000503051 YY1P25490 414 aa25.62■■□□□ 1.69
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USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC39A6Q13433 755 aa25.58■■□□□ 1.69
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USP46-AS1-201ENST00000503051 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.57■■□□□ 1.68
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USP46-AS1-201ENST00000503051 RFC4P35249 363 aa25.56■■□□□ 1.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.56■■□□□ 1.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 FCHSD2O94868 740 aa25.55■■□□□ 1.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.54■■□□□ 1.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEFMP07197 916 aa25.53■■□□□ 1.68
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USP46-AS1-201ENST00000503051 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.53■■□□□ 1.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.52■■□□□ 1.68
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USP46-AS1-201ENST00000503051 IL17REQ8NFR9 667 aa25.5■■□□□ 1.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.5■■□□□ 1.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.49■■□□□ 1.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.48■■□□□ 1.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP46-AS1-201ENST00000503051 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF790Q6PG37 636 aa25.45■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 BTBD11A6QL63 1104 aa25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL15A1P39059 1388 aa25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.44■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZPR1O75312 459 aa25.43■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.43■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.42■■□□□ 1.66
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