RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC6O95255 1503 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf37Q96NL8 207 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 NGLY1Q96IV0 654 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 CHRNA2Q15822 529 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-208ENST00000502484 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.34□□□□□ -0.75
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PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A2P04920 1241 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.33□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 ERBB3P21860 1342 aa10.33□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 GCC1Q96CN9 775 aa10.32□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.32□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 STK31Q9BXU1 1019 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 G2E3Q7L622 706 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.31□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 BTG4Q9NY30 223 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 ATP10DQ9P241 1426 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 AFF2P51816 1311 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 USP21Q9UK80 565 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 EVA1CP58658 441 aa10.29□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 TEFQ10587 303 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 FLIIQ13045 1269 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 STRN4Q9NRL3 753 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 SLIT2O94813 1529 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-208ENST00000502484 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.28□□□□□ -0.76
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PDE4D-208ENST00000502484 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 LNPKQ9C0E8 428 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD11A6QL63 1104 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 F6X3S4 739 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SEC24BO95487 1268 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 CEP85Q6P2H3 762 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 MEIS3Q99687 375 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 DCTPP1Q9H773 170 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 MEGF6O75095 1541 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 NECTIN2Q92692 538 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 16.6
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PDE4D-208ENST00000502484 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 NRAPQ86VF7 1730 aa10.25□□□□□ -0.77
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PDE4D-208ENST00000502484 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
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PDE4D-208ENST00000502484 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 USP35Q9P2H5 1018 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SPG7Q9UQ90 795 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 C5P01031 1676 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 MRC1P22897 1456 aa10.23□□□□□ -0.77
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