RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425		A6NJR5	290 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ARID3C	A6NKF2	412 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	RAD21	O60216	631 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	COL8A1	P27658	744 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	APBB1	O00213	710 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	TRAK2	O60296	914 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	AMPD1	P23109	780 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ARX	Q96QS3	562 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTC21B-208	ENST00000497425	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1B0GTH6	734 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GNB5	O14775	395 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	ARID3A	Q99856	593 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	BMP4	P12644	408 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GNRH1	P01148	92 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTC21B-208	ENST00000497425	THBS1	P07996	1170 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	SCTR	P47872	440 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ABL2	P42684	1182 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	CENPC	Q03188	943 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	EPX	P11678	715 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	FGFR3	P22607	806 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	PHKA2	P46019	1235 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ARAF	P10398	606 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	SOCS7	O14512	581 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	IL2RA	P01589	272 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	DGKG	P49619	791 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	C2CD2L	O14523	706 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	MSX1	P28360	303 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	CHRNA4	P43681	627 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTC21B-208	ENST00000497425	NR1H3	Q13133	447 aa		7.16	□□□□□ -1.26

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