RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496101.5

GCOM1-211, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,032 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-211ENST00000496101 GNAI3P08754 354 aa22.4■■□□□ 1.18
GCOM1-211ENST00000496101 PDE1AP54750 535 aa22.4■■□□□ 1.18
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.4■■□□□ 1.18
GCOM1-211ENST00000496101 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.39■■□□□ 1.18
GCOM1-211ENST00000496101 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 SOX12O15370 315 aa22.38■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.38■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.38■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.38■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 MAP3K5Q99683 1374 aa22.37■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 F6X3S4 739 aa22.37■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 ARXQ96QS3 562 aa22.37■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.37■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 FLIIQ13045 1269 aa22.36■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 APBB1O00213 710 aa22.35■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 HOXC9P31274 260 aa22.35■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 ATP8B2P98198 1209 aa22.35■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.34■■□□□ 1.17
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GCOM1-211ENST00000496101 AOX1Q06278 1338 aa22.33■■□□□ 1.17
GCOM1-211ENST00000496101 NLRP6P59044 892 aa22.33■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.33■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.32■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 STAP2Q9UGK3 403 aa22.32■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 AK9Q5TCS8 1911 aa22.32■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 MCM2P49736 904 aa22.31■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 IL17RAQ96F46 866 aa22.31■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 MX1P20591 662 aa22.3■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 LTN1O94822 1766 aa22.3■■□□□ 1.16
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GCOM1-211ENST00000496101 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.3■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.3■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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GCOM1-211ENST00000496101 IL17REQ8NFR9 667 aa22.28■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.28■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 MCCP23508 829 aa22.28■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF445P59923 1031 aa22.28■■□□□ 1.16
GCOM1-211ENST00000496101 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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GCOM1-211ENST00000496101 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.26■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.26■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.26■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 MCTP1Q6DN14 999 aa22.25■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.25■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 CHMLP26374 656 aa22.24■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 SSH3Q8TE77 659 aa22.24■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.24■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 NFAT5O94916 1531 aa22.24■■□□□ 1.15
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GCOM1-211ENST00000496101 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.23■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 ESPNB1AK53 854 aa22.22■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 ABTB2Q8N961 1025 aa22.22■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.22■■□□□ 1.15
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GCOM1-211ENST00000496101 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 NEK4P51957 841 aa22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 PKP1Q13835 747 aa22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 POLA2Q14181 598 aa22.21■■□□□ 1.15
GCOM1-211ENST00000496101 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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GCOM1-211ENST00000496101 TMX3Q96JJ7 454 aa22.2■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.2■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 IP6K1Q92551 441 aa22.19■■□□□ 1.14
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GCOM1-211ENST00000496101 NECTIN2Q92692 538 aa22.18■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.18■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.18■■□□□ 1.14
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GCOM1-211ENST00000496101 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 NCAPD2Q15021 1401 aa22.15■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 PALD1Q9ULE6 856 aa22.15■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GCOM1-211ENST00000496101 ERBB4Q15303 1308 aa22.14■■□□□ 1.13
GCOM1-211ENST00000496101 MBD3O95983 291 aa22.14■■□□□ 1.13
GCOM1-211ENST00000496101 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.14■■□□□ 1.13
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