RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 EYA1Q99502 592 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.58■■□□□ 1.21
TIMM17B-208ENST00000495490 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.58■■□□□ 1.21
TIMM17B-208ENST00000495490 ATG3Q9NT62 314 aa22.58■■□□□ 1.21
TIMM17B-208ENST00000495490 PHKG2P15735 406 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 APLP1P51693 650 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 TGFB2P61812 414 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 KDRP35968 1356 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 CDCA8Q53HL2 280 aa22.56■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.56■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.56■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 TOMM70O94826 608 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 C4AP0C0L4 1744 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 A0A0G2JLW4 131 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 BCS1LQ9Y276 419 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.52■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 POLKQ9UBT6 870 aa22.51■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ADRA2BP18089 450 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 WDR90Q96KV7 1748 aa22.49■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 GYS1P13807 737 aa22.49■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 DPEP1P16444 411 aa22.49■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.49■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 KCNA3P22001 575 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RPS6KA4O75676 772 aa22.46■■□□□ 1.19
TIMM17B-208ENST00000495490 FCHSD2O94868 740 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 SBF1O95248 1867 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 RFC4P35249 363 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 DCAF5Q96JK2 942 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 PCNTO95613 3336 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM17B-208ENST00000495490 PIM2Q9P1W9 311 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 TJP1Q07157 1748 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 JMYQ8N9B5 988 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 KLRG1Q96E93 195 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 HTRA3P83110 453 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 DDR1Q08345 913 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 FSTL1Q12841 308 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 CABP4P57796 275 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 FKBP8Q14318 412 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.34■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.34■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.33■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 RNF181Q9P0P0 153 aa22.33■■□□□ 1.17
TIMM17B-208ENST00000495490 MTHFSP49914 203 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 TM4SF1P30408 202 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 CHRNA5P30532 468 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 RRAGCQ9HB90 399 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.3■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TIMM17B-208ENST00000495490 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 PRELPP51888 382 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 ZPR1O75312 459 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 RASSF7Q02833 373 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM17B-208ENST00000495490 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms