RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494095.5

TNNT2-222, Transcript of troponin T2, cardiac type, human

TSL 5

Gene TNNT2, Length 3,014 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT2-222	ENST00000494095	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-222	ENST00000494095	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-222	ENST00000494095	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-222	ENST00000494095	ICE2	Q659A1	982 aa		14.58	□□□□□ -0.07
TNNT2-222	ENST00000494095	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	POLK	Q9UBT6	870 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	TBX22	Q9Y458	520 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	NWD1	Q149M9	1564 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	DLC1	Q96QB1	1528 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	GPATCH11	Q8N954	259 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	ADCY5	O95622	1261 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	TSPY26P	Q9H489	355 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	CEP83	Q9Y592	693 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	KIF16B	Q96L93	1317 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	TECPR2	O15040	1411 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	GUCY2C	P25092	1073 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	IRF6	O14896	467 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	SYCP1	Q15431	976 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	NEK11	Q8NG66	645 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	APAF1	O14727	1248 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	ATG3	Q9NT62	314 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	CCDC172	P0C7W6	258 aa		14.52	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	STK26	Q9P289	416 aa		14.52	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		14.52	□□□□□ -0.08
TNNT2-222	ENST00000494095	MYO1C	O00159	1063 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	AP5Z1	O43299	807 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	CASQ1	P31415	396 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	MET	P08581	1390 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	ABCC11	Q96J66	1382 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	PTCH1	Q13635	1447 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	REC8	O95072	547 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	DRC1	Q96MC2	740 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	NUCB2	P80303	420 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	PTPRU	Q92729	1446 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	GTF3C6	Q969F1	213 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	TNNT1	P13805	278 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	SMTNL1	A8MU46	457 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	PPP2R1A	P30153	589 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	SPC24	Q8NBT2	197 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TNNT2-222	ENST00000494095	KCNA6	P17658	529 aa		14.46	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	FAM212A	Q96EL1	285 aa		14.46	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		14.46	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	ERBB3	P21860	1342 aa		14.46	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	RNF217	Q8TC41	542 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	ADGRB2	O60241	1585 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	SATB1	Q01826	763 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	CTR9	Q6PD62	1173 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	PACS2	Q86VP3	889 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	14.44	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	ST5	P78524	1137 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
TNNT2-222	ENST00000494095	E2F4	Q16254	413 aa		14.44	□□□□□ -0.1

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