RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 KDRP35968 1356 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 ATP6V1AP38606 617 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 ATG3Q9NT62 314 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 GNPATO15228 680 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 ITPK1Q13572 414 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-208ENST00000493601 GRIN3BO60391 1043 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 CABP4P57796 275 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 SMIM5Q71RC9 77 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 IL13P35225 146 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 MTHFSP49914 203 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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PTPRU-208ENST00000493601 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-208ENST00000493601 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 C4AP0C0L4 1744 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 ADRA2BP18089 450 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 TJP1Q07157 1748 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 MMP10P09238 476 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 MRC1P22897 1456 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-208ENST00000493601 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 RPS6KA4O75676 772 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRU-208ENST00000493601 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 RFC4P35249 363 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 HMOX1P09601 288 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRU-208ENST00000493601 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-208ENST00000493601 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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PTPRU-208ENST00000493601 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.45■■□□□ 1.18
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PTPRU-208ENST00000493601 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 TGFB2P61812 414 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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PTPRU-208ENST00000493601 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-208ENST00000493601 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRU-208ENST00000493601 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 A0A0G2JLW4 131 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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PTPRU-208ENST00000493601 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRU-208ENST00000493601 ZPR1O75312 459 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRU-208ENST00000493601 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 DDR1Q08345 913 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-208ENST00000493601 TEFQ10587 303 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.31■■□□□ 1.16
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