RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.37■□□□□ 0.85
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 C1QTNF8P60827 252 aa20.07■□□□□ 0.8
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRKAR2BP31323 418 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF790Q6PG37 636 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NARFQ9UHQ1 456 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ATP10DQ9P241 1426 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.04■□□□□ 0.8
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