RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 RLBP1P12271 317 aa13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM27P14373 513 aa13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 DISP2A7MBM2 1401 aa13.27□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC125Q86Z20 511 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 RREB1Q92766 1687 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNQ9UQP3 1299 aa13.26□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0G2JS52 829 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 MYT1Q01538 1121 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 BARGINQ6ZT62 677 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 IL17REQ8NFR9 667 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.25□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.24□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.24□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.24□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM182BQ5T319 152 aa13.24□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.24□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.23□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.23□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.23□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT24Q2M2I5 525 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 USP35Q9P2H5 1018 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.22□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 SBF2Q86WG5 1849 aa13.21□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.21□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
GTPBP1-211ENST00000487538 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.2□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 MEGF6O75095 1541 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCC4O15439 1325 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 EVA1CP58658 441 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 TEFQ10587 303 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LGR6Q9HBX8 967 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SPG7Q9UQ90 795 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 TNS2Q63HR2 1409 aa13.19□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 LRP5O75197 1615 aa13.18□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.18□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.18□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.18□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRCP08575 1304 aa13.17□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL9O00512 1426 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 NHSQ6T4R5 1651 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 STK31Q9BXU1 1019 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.16□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 BTBD11A6QL63 1104 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHDP01880 384 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXB7P09629 217 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 PHKG2P15735 406 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.15□□□□□ -0.3
GTPBP1-211ENST00000487538 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC4A2P04920 1241 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 BAG6P46379 1132 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.14□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 SCN11AQ9UI33 1791 aa13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 MRC1P22897 1456 aa13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM37O94972 964 aa13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.12□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 DCAF5Q96JK2 942 aa13.12□□□□□ -0.31
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