RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486514.5

BNC2-209, Transcript of basonuclin 2, human

TSL 2

Gene BNC2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BNC2-209	ENST00000486514	GNPAT	O15228	680 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	GRIN3B	O60391	1043 aa		33.4	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.4	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.39	■■■□□ 2.94
BNC2-209	ENST00000486514	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	C1QTNF8	P60827	252 aa		33.36	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BNC2-209	ENST00000486514	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	CABP4	P57796	275 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	IL13	P35225	146 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	MTHFS	P49914	203 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
BNC2-209	ENST00000486514	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	MMP10	P09238	476 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	ATP10D	Q9P241	1426 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.21	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BNC2-209	ENST00000486514	ADCY9	O60503	1353 aa		33.2	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	ADRA2B	P18089	450 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	TJP1	Q07157	1748 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	GYS1	P13807	737 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	RFC4	P35249	363 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BNC2-209	ENST00000486514	HMOX1	P09601	288 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.11	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514		A0A0G2JLW4	131 aa		33.09	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	MRC1	P22897	1456 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
BNC2-209	ENST00000486514	TGFB2	P61812	414 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	FKBP8	Q14318	412 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	DPEP1	P16444	411 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
BNC2-209	ENST00000486514	DDR1	Q08345	913 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BNC2-209	ENST00000486514	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
BNC2-209	ENST00000486514	KCNA3	P22001	575 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BNC2-209	ENST00000486514	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
BNC2-209	ENST00000486514	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
BNC2-209	ENST00000486514	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.95	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	FCHSD2	O94868	740 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.92	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	TM4SF1	P30408	202 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	KIF3C	O14782	793 aa		32.9	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.89	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
BNC2-209	ENST00000486514	ZPR1	O75312	459 aa		32.89	■■■□□ 2.86

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