RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.39■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.39■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.39■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 MTHFSP49914 203 aa27.38■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 GNPATO15228 680 aa27.37■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.36■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.35■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 IL13P35225 146 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 ITPK1Q13572 414 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 GRIN3BO60391 1043 aa27.33■■□□□ 1.97
ACTB-212ENST00000484841 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 SMIM5Q71RC9 77 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 KDRP35968 1356 aa27.29■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-212ENST00000484841 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.26■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.26■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 HMOX1P09601 288 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.956e-46■□□□□ 9.8
ACTB-212ENST00000484841 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 ADRA2BP18089 450 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 RFC4P35249 363 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ACTB-212ENST00000484841 RPS6KA4O75676 772 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 MMP10P09238 476 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.17■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.17■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 LGR6Q9HBX8 967 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
ACTB-212ENST00000484841 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.13■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 C4AP0C0L4 1744 aa27.12■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 TJP1Q07157 1748 aa27.12■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 CFAP53Q96M91 514 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 GYS1P13807 737 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 TGFB2P61812 414 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF8P60827 252 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-212ENST00000484841 MRC1P22897 1456 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A6Q13433 755 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 UTRNP46939 3433 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 ZPR1O75312 459 aa27.05■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 TEFQ10587 303 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 NUDCQ9Y266 331 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 ATP10DQ9P241 1426 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 A0A0G2JLW4 131 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 BCS1LQ9Y276 419 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-212ENST00000484841 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.01■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 FKBP8Q14318 412 aa27■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 DPEP1P16444 411 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 FCHSD2O94868 740 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 STARD3NLO95772 234 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 PRKAR2BP31323 418 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 NARFQ9UHQ1 456 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.95■■□□□ 1.9
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