RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 SKIP12755 728 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 POM121CA8CG34 1229 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 CENPCQ03188 943 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF15Q8N660 670 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 ALG2Q9H553 416 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 SCRIBQ14160 1630 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 MSTNO14793 375 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 TLR1Q15399 786 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 EML3Q32P44 896 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 XAGE2Q96GT9 111 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS2O95450 1211 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 GNASQ5JWF2 1037 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 PHKA2P46019 1235 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 GDF10P55107 478 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 XP32Q5T750 250 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 H7C1W4 665 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 SCNN1DP51172 638 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PSME1Q06323 249 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA4Q13772 614 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 WDR44Q5JSH3 913 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 NOD1Q9Y239 953 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L5A8MUK1 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM23O75077 832 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 INHAP05111 366 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PODNQ7Z5L7 613 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GMCL1Q96IK5 515 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GPAMQ9HCL2 828 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2IP78347 998 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 C4orf17Q53FE4 359 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GTH6 734 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GPR25O00155 361 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 F11P03951 625 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 DBN1Q16643 649 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G4AP47712 749 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GLMNQ92990 594 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 SMTNP53814 917 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PGBD3Q8N328 593 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 UCN2Q96RP3 112 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L3A6NCW0 530 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L4A6NCW7 530 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 ATP9BO43861 1147 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM50Q86XT4 487 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF5Q96JK2 942 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 GAS6Q14393 721 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 BACH1O14867 736 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 MSX1P28360 303 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 ATP1A2P50993 1020 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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