RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ITPK1Q13572 414 aa25.43■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 MSL1Q68DK7 614 aa25.43■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 CABP4P57796 275 aa25.42■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 KLHL34Q8N239 644 aa25.42■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 C4BP0C0L5 1744 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 PHF14O94880 888 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.39■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K5Q99683 1374 aa25.39■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.38■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.36■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 GNPATO15228 680 aa25.35■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 YY1P25490 414 aa25.35■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 SSFA2P28290 1259 aa25.34■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 LGR6Q9HBX8 967 aa25.34■■□□□ 1.65
UPP1-211ENST00000482015 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.32■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.3■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.29■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 PPP2R1AP30153 589 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 GPR162Q16538 588 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
UPP1-211ENST00000482015 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 CFAP53Q96M91 514 aa25.26■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.25■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 UTRNP46939 3433 aa25.25■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A6Q13433 755 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.23■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 RPS6KA4O75676 772 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 MRC1P22897 1456 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-211ENST00000482015 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.2■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.2■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 ADRA2BP18089 450 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 PRKAR2BP31323 418 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 NUDCQ9Y266 331 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 RFC4P35249 363 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 IL17REQ8NFR9 667 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 MMP10P09238 476 aa25.17■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.16■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 GYS1P13807 737 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 TJP1Q07157 1748 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-211ENST00000482015 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 TEFQ10587 303 aa25.13■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.12■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.12■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.11■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 FCHSD2O94868 740 aa25.1■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.1■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 GRIN3BO60391 1043 aa25.09■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.09■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UPP1-211ENST00000482015 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 FKBP8Q14318 412 aa25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 ZNF790Q6PG37 636 aa25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.06■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 C4AP0C0L4 1744 aa25.06■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 MCM10Q7L590 875 aa25.04■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 BTBD11A6QL63 1104 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 KCNQ3O43525 872 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 ZPR1O75312 459 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 CHD4Q14839 1912 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 DCTN1Q14203 1278 aa25.02■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.02■■□□□ 1.6
UPP1-211ENST00000482015 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms