RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 DPYDQ12882 1025 aa7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 CNKSR1Q969H4 720 aa7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.56□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 SFI1A8K8P3 1242 aa7.55□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.55□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 STK32AQ8WU08 396 aa7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 NLRP3Q96P20 1036 aa7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 SEC13P55735 322 aa7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 CENPCQ03188 943 aa7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
PHF20-210ENST00000480940 TTLL8A6PVC2 850 aa7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SMTNP53814 917 aa7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 RNF217Q8TC41 542 aa7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 M0R2N6 131 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 BACH1O14867 736 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 GPC1P35052 558 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 EPHA4P54764 986 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TLR1Q15399 786 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TNS4Q8IZW8 715 aa7.51□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 A6NJY4 79 aa7.5□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.5□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 POTECB2RU33 542 aa7.5□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TRIM47Q96LD4 638 aa7.5□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.5□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SOBPA7XYQ1 873 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 LGR5O75473 907 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 FOXK2Q01167 660 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 MTFR1Q15390 333 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 KIFC2Q96AC6 838 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SENP2Q9HC62 589 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 USP3Q9Y6I4 520 aa7.49□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 CDK2AP1O14519 115 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 RETREG2Q8NC44 543 aa7.48□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 CARNS1A5YM72 827 aa7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 MAN1A2O60476 641 aa7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 HINFPQ9BQA5 517 aa7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SLAIN2Q9P270 581 aa7.47□□□□□ -1.21
PHF20-210ENST00000480940 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 POU4F2Q12837 409 aa7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 TBCELQ5QJ74 424 aa7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.46□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 C21orf2O43822 256 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 RHOQP17081 205 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 C4orf17Q53FE4 359 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 USTQ9Y2C2 406 aa7.45□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 WEE1P30291 646 aa7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 GNASQ5JWF2 1037 aa7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 NBPF15Q8N660 670 aa7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.44□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 PRMT3O60678 531 aa7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 OCLNQ16625 522 aa7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.43□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.42□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 IGFBP4P22692 258 aa7.42□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 PHKA2P46019 1235 aa7.42□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 WDR44Q5JSH3 913 aa7.42□□□□□ -1.22
PHF20-210ENST00000480940 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms