RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PRR29P0C7W0 189 aa11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 ATP10DQ9P241 1426 aa11.77□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 ITPK1Q13572 414 aa11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 AK7Q96M32 723 aa11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 EYA1Q99502 592 aa11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 FLT4P35916 1363 aa11.77□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.76□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 SIK1P57059 783 aa11.76□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 NUBP1P53384 320 aa11.75□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 SPG7Q9UQ90 795 aa11.75□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.75□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ATP6V1AP38606 617 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 IFFO2Q5TF58 517 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ATG3Q9NT62 314 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 POLKQ9UBT6 870 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.74□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 PHKG2P15735 406 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 SSFA2P28290 1259 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 CDCA8Q53HL2 280 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.72□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ADCY9O60503 1353 aa11.72□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 GNPATO15228 680 aa11.72□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.72□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 17.6
CTPS1-208ENST00000479480 NCAPD2Q15021 1401 aa11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 KIF3CO14782 793 aa11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 MMP10P09238 476 aa11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-208ENST00000479480 C4BP0C0L5 1744 aa11.7□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0G2JLW4 131 aa11.7□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 HSPA6P17066 643 aa11.7□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 CEP350Q5VT06 3117 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 C5P01031 1676 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 RGL2O15211 777 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 DPEP1P16444 411 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 BCS1LQ9Y276 419 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 ITGB4P16144 1822 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 RPS6KA4O75676 772 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 GYS1P13807 737 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 KCNA3P22001 575 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 TGFB2P61812 414 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-208ENST00000479480 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 CABP4P57796 275 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF5Q96JK2 942 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 PANK3Q9H999 370 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 KDRP35968 1356 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 FCHSD2O94868 740 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 RFC4P35249 363 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 MTHFSP49914 203 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.61□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 TOMM70O94826 608 aa11.61□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.61□□□□□ -0.55
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