RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471837.1

PTPRZ1-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRZ1, Length 568 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-205ENST00000471837 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 UTRNP46939 3433 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 TJP1Q07157 1748 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 KDRP35968 1356 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 ATP6V1AP38606 617 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 ATG3Q9NT62 314 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 GNPATO15228 680 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRZ1-205ENST00000471837 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 SSFA2P28290 1259 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 DCAF5Q96JK2 942 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 CABP4P57796 275 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 IL13P35225 146 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRZ1-205ENST00000471837 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 MTHFSP49914 203 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 HMOX1P09601 288 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 MRC1P22897 1456 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 GRIN3BO60391 1043 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 MMP10P09238 476 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1-205ENST00000471837 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 ATP10DQ9P241 1426 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 RPS6KA4O75676 772 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 LGR6Q9HBX8 967 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 GYS1P13807 737 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 RFC4P35249 363 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 ADRA2BP18089 450 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 C1QTNF8P60827 252 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRZ1-205ENST00000471837 SLC39A6Q13433 755 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 ADCY9O60503 1353 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 A0A0G2JLW4 131 aa19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 SCN7AQ01118 1682 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 FKBP8Q14318 412 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 BCS1LQ9Y276 419 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1-205ENST00000471837 MIER1Q8N108 512 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 COL15A1P39059 1388 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 DPEP1P16444 411 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 DDR1Q08345 913 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 TGFB2P61812 414 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1-205ENST00000471837 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms