RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470504.1

PTPRZ1-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRZ1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-204ENST00000470504 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRZ1-204ENST00000470504 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRZ1-204ENST00000470504 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 GNPATO15228 680 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 HSPA6P17066 643 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 SMIM5Q71RC9 77 aa11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 EYA1Q99502 592 aa11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 WWC3Q9ULE0 1092 aa11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 PHKG2P15735 406 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ATP6V1AP38606 617 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ITPK1Q13572 414 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 KDRP35968 1356 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 CEP350Q5VT06 3117 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 MMP10P09238 476 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 C4AP0C0L4 1744 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ATG3Q9NT62 314 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 POLKQ9UBT6 870 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 C10orf71Q711Q0 1435 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 KIF3CO14782 793 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 TGFB2P61812 414 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRZ1-204ENST00000470504 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 BCS1LQ9Y276 419 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 RFC4P35249 363 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 DCAF5Q96JK2 942 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 A0A0G2JLW4 131 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 RPS6KA4O75676 772 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 TOMM70O94826 608 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 FCHSD2O94868 740 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 GYS1P13807 737 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 APLP1P51693 650 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 TJP1Q07157 1748 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 WDR90Q96KV7 1748 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 DPEP1P16444 411 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 CABP4P57796 275 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCB7O75027 752 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRZ1-204ENST00000470504 SBF1O95248 1867 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 MTHFSP49914 203 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 NMRK2Q9NPI5 230 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 PIM2Q9P1W9 311 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 KCNA3P22001 575 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 DDR1Q08345 913 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 FKBP8Q14318 412 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRZ1-204ENST00000470504 MORC1Q86VD1 984 aa10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms