RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ADCY5O95622 1261 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 CUL4AQ13619 759 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 IL25Q9H293 177 aa16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 AGLP35573 1532 aa16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CHMLP26374 656 aa16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 MX1P20591 662 aa16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGSF3O75054 1194 aa16.31■□□□□ 0.2
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SH3BP1-206ENST00000469947 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.29■□□□□ 0.2
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SH3BP1-206ENST00000469947 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-206ENST00000469947 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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SH3BP1-206ENST00000469947 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-206ENST00000469947 ANAPC15P60006 121 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.27■□□□□ 0.2
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 SYT1P21579 422 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 IL17RAQ96F46 866 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0232Q92628 1395 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 AK2P54819 239 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-206ENST00000469947 CPS1P31327 1500 aa16.26■□□□□ 0.19
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