RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	GNPAT	O15228	680 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	SIK1	P57059	783 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	TGFB2	P61812	414 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP10	P09238	476 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP27B1	O15528	508 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	PIGB	Q92521	554 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	FCHSD2	O94868	740 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	ADRA2B	P18089	450 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	FSTL1	Q12841	308 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22	3e-6	■□□□□ 8.1
TTLL3-223	ENST00000466245	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-223	ENST00000466245	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	EYA1	Q99502	592 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0G2JLW4	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	RFC4	P35249	363 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	KDR	P35968	1356 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	CAPN15	O75808	1086 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	DPEP1	P16444	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	ITPK1	Q13572	414 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	PHKG2	P15735	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-223	ENST00000466245	IL13	P35225	146 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	MTHFS	P49914	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	PRELP	P51888	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	GYS1	P13807	737 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	SBF1	O95248	1867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	PCNT	O95613	3336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	CABP4	P57796	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	HTRA3	P83110	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-223	ENST00000466245	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	ZPR1	O75312	459 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNA3	P22001	575 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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