RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 DCAF5Q96JK2 942 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 AK7Q96M32 723 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 ITPK1Q13572 414 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 ATP6V1AP38606 617 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 PHF14O94880 888 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 KDRP35968 1356 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-207ENST00000465957 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 HMOX1P09601 288 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 CABP4P57796 275 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 GNPATO15228 680 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 GPR162Q16538 588 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 SSFA2P28290 1259 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-207ENST00000465957 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 LGR6Q9HBX8 967 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HPS1-207ENST00000465957 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.94■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 RPS6KA4O75676 772 aa21.92■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 CHD4Q14839 1912 aa21.92■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 SLC39A6Q13433 755 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 MMP10P09238 476 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HPS1-207ENST00000465957 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.89■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 RFC4P35249 363 aa21.88■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 TJP1Q07157 1748 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 GYS1P13807 737 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 PPP2R1AP30153 589 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 MRC1P22897 1456 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 GRIN3BO60391 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 CFAP53Q96M91 514 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 IL17REQ8NFR9 667 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HPS1-207ENST00000465957 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 PRKAR2BP31323 418 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 C4AP0C0L4 1744 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 FKBP8Q14318 412 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 NUDCQ9Y266 331 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 TEFQ10587 303 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 A0A0G2JLW4 131 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-207ENST00000465957 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.77■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 DDR1Q08345 913 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 TGFB2P61812 414 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-207ENST00000465957 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.75■■□□□ 1.07
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