RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ST18O60284 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.52■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC37A3O60309 1634 aa22.52■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 SSFA2P28290 1259 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 IL17REQ8NFR9 667 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 PANK2Q9BZ23 570 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 NUCB2P80303 420 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 NWD1Q149M9 1564 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 ATP8B2P98198 1209 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 MX1P20591 662 aa22.46■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYNE4-204ENST00000465425 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 USP54Q70EL1 1684 aa22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 RILPL2Q969X0 211 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 USP44Q9H0E7 712 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 CACNA1FO60840 1977 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 MCCP23508 829 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 IP6K1Q92551 441 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-204ENST00000465425 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 MCTP1Q6DN14 999 aa22.39■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.39■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.39■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 NEK4P51957 841 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 PSME1Q06323 249 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 STAP2Q9UGK3 403 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF4Q96M43 638 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 CHMLP26374 656 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 LTN1O94822 1766 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 MCM2P49736 904 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 PKP1Q13835 747 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 SSH3Q8TE77 659 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 AOX1Q06278 1338 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 AK9Q5TCS8 1911 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 RAB11FIP3O75154 756 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 HOXB7P09629 217 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 TEFQ10587 303 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 LGR6Q9HBX8 967 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ANAPC15P60006 121 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.33■■□□□ 1.17
SYNE4-204ENST00000465425 SRGAP3O43295 1099 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 TMX3Q96JJ7 454 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 NFAT5O94916 1531 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 BTBD11A6QL63 1104 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 POLA2Q14181 598 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-204ENST00000465425 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.29■■□□□ 1.16
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