RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465147.1

SEMA5B-208, Transcript of semaphorin 5B, human

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA5B-208	ENST00000465147	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SEMA5B-208	ENST00000465147	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SEMA5B-208	ENST00000465147	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SEMA5B-208	ENST00000465147	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	KDR	P35968	1356 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	GNPAT	O15228	680 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	MTHFS	P49914	203 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	SSFA2	P28290	1259 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SEMA5B-208	ENST00000465147	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	CABP4	P57796	275 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	HMOX1	P09601	288 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SEMA5B-208	ENST00000465147	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SEMA5B-208	ENST00000465147	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	MMP10	P09238	476 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	RPS6KA4	O75676	772 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	TJP1	Q07157	1748 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	GRIN3B	O60391	1043 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	GYS1	P13807	737 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	C4A	P0C0L4	1744 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	SLC39A6	Q13433	755 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEMA5B-208	ENST00000465147	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	ADRA2B	P18089	450 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	RFC4	P35249	363 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	MRC1	P22897	1456 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SEMA5B-208	ENST00000465147	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147		A0A0G2JLW4	131 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	FKBP8	Q14318	412 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	DDR1	Q08345	913 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	DPEP1	P16444	411 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SEMA5B-208	ENST00000465147	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	TGFB2	P61812	414 aa		27.56	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ADCY9	O60503	1353 aa		27.56	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	KCNA3	P22001	575 aa		27.55	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		27.55	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		27.55	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.54	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.53	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	TM4SF1	P30408	202 aa		27.53	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		27.53	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.53	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.52	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.52	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
SEMA5B-208	ENST00000465147	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SEMA5B-208	ENST00000465147	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
SEMA5B-208	ENST00000465147	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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