RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa41.6■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 IGSF1Q8N6C5 1336 aa41.59■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 ERVV-2B6SEH9 535 aa41.52■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 DCAF5Q96JK2 942 aa41.52■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 MORC1Q86VD1 984 aa41.51■■■■■ 4.24
CPTP-202ENST00000464957 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 WWC3Q9ULE0 1092 aa41.5■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.48■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 ATP10DQ9P241 1426 aa41.46■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 KDRP35968 1356 aa41.46■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 CABP4P57796 275 aa41.45■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 TRAPPC3LQ5T215 181 aa41.45■■■■■ 4.23
CPTP-202ENST00000464957 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 MMP10P09238 476 aa41.43■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 C1orf141Q5JVX7 400 aa41.42■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 SLC4A9Q96Q91 983 aa41.41■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 KNSTRNQ9Y448 316 aa41.41■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 MTHFSP49914 203 aa41.39■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 AEBP1Q8IUX7 1158 aa41.39■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 ZNF831Q5JPB2 1677 aa41.39■■■■■ 4.22
CPTP-202ENST00000464957 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 NLGN1Q8N2Q7 840 aa41.37■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 ADRA2BP18089 450 aa41.35■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 SULT6B1Q6IMI4 303 aa41.35■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa41.35■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 RFC4P35249 363 aa41.33■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 ADCY9O60503 1353 aa41.32■■■■■ 4.21
CPTP-202ENST00000464957 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 RPS6KA4O75676 772 aa41.31■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa41.29■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 TGFB2P61812 414 aa41.27■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 PXDNLA1KZ92 1463 aa41.27■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 GYS1P13807 737 aa41.26■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 IL13P35225 146 aa41.26■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 CCDC87Q9NVE4 849 aa41.26■■■■■ 4.2
CPTP-202ENST00000464957 PARP3Q9Y6F1 533 aa41.25■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 KIF13BQ9NQT8 1826 aa41.24■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 C10orf71Q711Q0 1435 aa41.22■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 A0A0G2JLW4 131 aa41.22■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 BCS1LQ9Y276 419 aa41.22■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 CRKLP46109 303 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 C4AP0C0L4 1744 aa41.21■■■■■ 4.19
CPTP-202ENST00000464957 AKAP4Q5JQC9 854 aa41.19■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa41.18■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 SCN11AQ9UI33 1791 aa41.16■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 KIF7Q2M1P5 1343 aa41.15■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 DPEP1P16444 411 aa41.14■■■■■ 4.18
CPTP-202ENST00000464957 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 TJP1Q07157 1748 aa41.13■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 SLC52A2Q9HAB3 445 aa41.12■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 FCHSD2O94868 740 aa41.11■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 HMOX1P09601 288 aa41.11■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa41.11■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 LGR6Q9HBX8 967 aa41.09■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 FKBP8Q14318 412 aa41.07■■■■■ 4.17
CPTP-202ENST00000464957 RNMTO43148 476 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 DNAJC10Q8IXB1 793 aa41.06■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 HSPA6P17066 643 aa41.05■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 ZPR1O75312 459 aa41.03■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 KIF3CO14782 793 aa41.02■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 SLC39A6Q13433 755 aa41.02■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 DDR1Q08345 913 aa41.01■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 PIM2Q9P1W9 311 aa41.01■■■■■ 4.16
CPTP-202ENST00000464957 KCNA3P22001 575 aa41■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 MRC1P22897 1456 aa40.99■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 USPL1Q5W0Q7 1092 aa40.98■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CPTP-202ENST00000464957 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 TM4SF1P30408 202 aa40.93■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa40.93■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa40.93■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 KCPQ6ZWJ8 1503 aa40.92■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 C9orf131Q5VYM1 1079 aa40.91■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 CHRNA5P30532 468 aa40.9■■■■■ 4.14
CPTP-202ENST00000464957 CEP350Q5VT06 3117 aa40.89■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms