RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PTPRT	O14522	1441 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	SAMD9	Q5K651	1589 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	MEIOB	Q8N635	442 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	CBLB	Q13191	982 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PLCH2	O75038	1416 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	PTK2	Q05397	1052 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	GOPC	Q9HD26	462 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CEP170-209	ENST00000464936	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	NCOA1	Q15788	1441 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	RELB	Q01201	579 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PNMA1	Q8ND90	353 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	RFC5	P40937	340 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PIP4K2B	P78356	416 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	CLIP1	P30622	1438 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	TOM1	O60784	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	HSPA1L	P34931	641 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	PTS	Q03393	145 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	C3	P01024	1663 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	NPAT	Q14207	1427 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CEP170-209	ENST00000464936	KIF14	Q15058	1648 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	KDM5C	P41229	1560 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	AGL	P35573	1532 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936		Q6ZVU0	165 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	EEA1	Q15075	1411 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	RERE	Q9P2R6	1566 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ZMYM3	Q14202	1370 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CDC14C	A4D256	554 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	SPINT1	O43278	529 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	FLII	Q13045	1269 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ABCA6	Q8N139	1617 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms