RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ERC2O15083 957 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 PANK2Q9BZ23 570 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 NWD1Q149M9 1564 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 LRRC37A3O60309 1634 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 ST18O60284 1047 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 PTMSP20962 102 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 MRE11P49959 708 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 ATP8B2P98198 1209 aa25.14■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.14■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 MX1P20591 662 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 USP44Q9H0E7 712 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 IP6K1Q92551 441 aa25.09■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 NUCB2P80303 420 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 RILPL2Q969X0 211 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-208ENST00000460766 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.08■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 NBPF4Q96M43 638 aa25.08■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 PSME1Q06323 249 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 LGR6Q9HBX8 967 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 PKP1Q13835 747 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 USP54Q70EL1 1684 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.04■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.04■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.04■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 MCTP1Q6DN14 999 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 NEK4P51957 841 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG5O94827 1062 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 CHMLP26374 656 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 STAP2Q9UGK3 403 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-208ENST00000460766 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 MCCP23508 829 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 SSH3Q8TE77 659 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 KLHL40Q2TBA0 621 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 TEFQ10587 303 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 UNC5CLQ8IV45 518 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 KCNH5Q8NCM2 988 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 LTN1O94822 1766 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 KCNQ3O43525 872 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 NFAT5O94916 1531 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 BTBD11A6QL63 1104 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 SRGAP3O43295 1099 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 PALD1Q9ULE6 856 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 ANXA1P04083 346 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 HOXB7P09629 217 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 RAB11FIP3O75154 756 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 TMX3Q96JJ7 454 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 AK9Q5TCS8 1911 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 CACNA1FO60840 1977 aa24.95■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 POLA2Q14181 598 aa24.95■■□□□ 1.59
IMP4-208ENST00000460766 AOX1Q06278 1338 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 BEND3Q5T5X7 828 aa24.95■■□□□ 1.58
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