RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.52■□□□□ 0.24
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NISCH-203ENST00000460759 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NISCH-203ENST00000460759 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NISCH-203ENST00000460759 CACNA1FO60840 1977 aa16.5■□□□□ 0.23
NISCH-203ENST00000460759 ADAMTS2O95450 1211 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-203ENST00000460759 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-203ENST00000460759 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.45■□□□□ 0.22
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NISCH-203ENST00000460759 PANK1Q8TE04 598 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-203ENST00000460759 ABCC4O15439 1325 aa16.4■□□□□ 0.22
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NISCH-203ENST00000460759 C5P01031 1676 aa16.35■□□□□ 0.21
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NISCH-203ENST00000460759 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 ITGB4P16144 1822 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 RGS12O14924 1447 aa16.35■□□□□ 0.21
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NISCH-203ENST00000460759 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 GLI3P10071 1580 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-203ENST00000460759 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 FLIIQ13045 1269 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 TNNQ9UQP3 1299 aa16.33■□□□□ 0.2
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