RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPG7Q9UQ90 795 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTBD11A6QL63 1104 aa21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.89■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.89■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MEGF6O75095 1541 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C8orf34Q49A92 452 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GCC1Q96CN9 775 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FLIIQ13045 1269 aa21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 G2E3Q7L622 706 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHKG2P15735 406 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NECTIN2Q92692 538 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUCB1Q02818 461 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 F6X3S4 739 aa21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNQ3O43525 872 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRC1P22897 1456 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP10DQ9P241 1426 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF5Q96JK2 942 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MEIS3Q99687 375 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNAI3P08754 354 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP85Q6P2H3 762 aa21.77■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.77■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.77■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MSH5O43196 834 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMMRO75330 724 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LNPKQ9C0E8 428 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP27B1O15528 508 aa21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EVA1CP58658 441 aa21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNAI2P04899 355 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF790Q6PG37 636 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCTPP1Q9H773 170 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL2RBP14784 551 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STRN4Q9NRL3 753 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HYPKQ9NX55 129 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C5P01031 1676 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CABP4P57796 275 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC39A6Q13433 755 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADCY9O60503 1353 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHLPP1O60346 1717 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANXA1P04083 346 aa21.64■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms