RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	CABP4	P57796	275 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	ITPK1	Q13572	414 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	SSFA2	P28290	1259 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	PHF14	O94880	888 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNPAT	O15228	680 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	YY1	P25490	414 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CB-208	ENST00000455580	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPR162	Q16538	588 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADRA2B	P18089	450 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	MRC1	P22897	1456 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CB-208	ENST00000455580	UTRN	P46939	3433 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	RFC4	P35249	363 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CB-208	ENST00000455580	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	FCHSD2	O94868	740 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	MMP10	P09238	476 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	TJP1	Q07157	1748 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	GYS1	P13807	737 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEF	Q10587	303 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.08	■■■□□ 2.73	2e-6	■□□□□ 8.5
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRIN3B	O60391	1043 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHD4	Q14839	1912 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	FKBP8	Q14318	412 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZPR1	O75312	459 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	STARD3NL	O95772	234 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	RALBP1	Q15311	655 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CB-208	ENST00000455580	TGFB2	P61812	414 aa		31.95	■■■□□ 2.71

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