RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.65■■□□□ 1.54
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CXorf40A-210ENST00000448332 ATG3Q9NT62 314 aa24.64■■□□□ 1.54
CXorf40A-210ENST00000448332 PPP2R1AP30153 589 aa24.62■■□□□ 1.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 KLHL34Q8N239 644 aa24.61■■□□□ 1.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.59■■□□□ 1.53
CXorf40A-210ENST00000448332 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.59■■□□□ 1.53
CXorf40A-210ENST00000448332 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.59■■□□□ 1.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.58■■□□□ 1.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
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CXorf40A-210ENST00000448332 MRC1P22897 1456 aa24.56■■□□□ 1.52
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CXorf40A-210ENST00000448332 SYT17Q9BSW7 474 aa24.53■■□□□ 1.52
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CXorf40A-210ENST00000448332 TEFQ10587 303 aa24.51■■□□□ 1.51
CXorf40A-210ENST00000448332 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.5■■□□□ 1.51
CXorf40A-210ENST00000448332 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.5■■□□□ 1.51
CXorf40A-210ENST00000448332 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CXorf40A-210ENST00000448332 TJP1Q07157 1748 aa24.48■■□□□ 1.51
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CXorf40A-210ENST00000448332 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.48■■□□□ 1.51
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CXorf40A-210ENST00000448332 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.37■■□□□ 1.49
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CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF790Q6PG37 636 aa24.35■■□□□ 1.49
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CXorf40A-210ENST00000448332 COL15A1P39059 1388 aa24.31■■□□□ 1.48
CXorf40A-210ENST00000448332 ZPR1O75312 459 aa24.31■■□□□ 1.48
CXorf40A-210ENST00000448332 GYS1P13807 737 aa24.31■■□□□ 1.48
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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CXorf40A-210ENST00000448332 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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