RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 CABP2Q9NPB3 220 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 CASZ1Q86V15 1759 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 CCDC7Q96M83 1385 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 IL2RBP14784 551 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 SBF2Q86WG5 1849 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 USP6P35125 1406 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ADGRB1O14514 1584 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ZNF827Q17R98 1081 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 EVC2Q86UK5 1308 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 APLP1P51693 650 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZNB5 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 PEAK1Q9H792 1746 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 WDR70Q9NW82 654 aa7.34□□□□□ -1.23
CBX1-204ENST00000444685 AKAP12Q02952 1782 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 LRRC37A3O60309 1634 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 ATP10DQ9P241 1426 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PSEN1P49768 467 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 KCNQ4P56696 695 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TOMM70O94826 608 aa7.31□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TNS2Q63HR2 1409 aa7.31□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R37O75864 691 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 MSL1Q68DK7 614 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 MFRPQ9BY79 579 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 USP47Q96K76 1375 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 SLIT3O75094 1523 aa7.29□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TMC1Q8TDI8 760 aa7.29□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.29□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TNS4Q8IZW8 715 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 NHSQ6T4R5 1651 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 COL18A1P39060 1754 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1-204ENST00000444685 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 KIF3CO14782 793 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 AMPHP49418 695 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 DOK7Q18PE1 504 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 IP6K1Q92551 441 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 AK7Q96M32 723 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 RGPD5Q99666 1765 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 BTAF1O14981 1849 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 ABCC6O95255 1503 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 PRELPP51888 382 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 NME9Q86XW9 330 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-204ENST00000444685 KLRG1Q96E93 195 aa7.25□□□□□ -1.25
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