RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.3■■□□□ 1.64
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSPA6P17066 643 aa25.27■■□□□ 1.64
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFFO2Q5TF58 517 aa25.26■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.25■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDRP35968 1356 aa25.25■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.24■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.23■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.22■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.22■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.22■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.22■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCAF5Q96JK2 942 aa25.21■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCS1LQ9Y276 419 aa25.21■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.2■■□□□ 1.63
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A0G2JLW4 131 aa25.2■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF3CO14782 793 aa25.2■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 TGFB2P61812 414 aa25.2■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.2■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADRA2BP18089 450 aa25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.19■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.18■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 RFC4P35249 363 aa25.18■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.18■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.18■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 CABP4P57796 275 aa25.17■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 C4AP0C0L4 1744 aa25.17■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 GYS1P13807 737 aa25.16■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPS6KA4O75676 772 aa25.15■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.15■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.15■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 DPEP1P16444 411 aa25.14■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.14■■□□□ 1.62
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 FCHSD2O94868 740 aa25.13■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTHFSP49914 203 aa25.12■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.12■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 PANK3Q9H999 370 aa25.12■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.11■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 APLP1P51693 650 aa25.08■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 MORC1Q86VD1 984 aa25.08■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.08■■□□□ 1.61
UPK3BP1-201ENST00000428678 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.07■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.06■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.06■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNA3P22001 575 aa25.05■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.05■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 TJP1Q07157 1748 aa25.04■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 FKBP8Q14318 412 aa25.04■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.04■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIM2Q9P1W9 311 aa25.04■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.03■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDR1Q08345 913 aa25.02■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.01■■□□□ 1.59
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CHRNA5P30532 468 aa24.98■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL13P35225 146 aa24.98■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF181Q9P0P0 153 aa24.98■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.98■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZPR1O75312 459 aa24.97■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.97■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.96■■□□□ 1.59
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.95■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.95■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.95■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.95■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 TM4SF1P30408 202 aa24.94■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.94■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR90Q96KV7 1748 aa24.94■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 LGR6Q9HBX8 967 aa24.93■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 SBF1O95248 1867 aa24.92■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC39A6Q13433 755 aa24.91■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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