RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 SSFA2P28290 1259 aa28.39■■■□□ 2.14
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UBXN4-204ENST00000426921 KLHL34Q8N239 644 aa28.39■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 CHD4Q14839 1912 aa28.39■■■□□ 2.13
UBXN4-204ENST00000426921 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.38■■■□□ 2.13
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UBXN4-204ENST00000426921 ATP6V1AP38606 617 aa28.36■■■□□ 2.13
UBXN4-204ENST00000426921 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.35■■■□□ 2.13
UBXN4-204ENST00000426921 GPR162Q16538 588 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN4-204ENST00000426921 PHF14O94880 888 aa28.33■■■□□ 2.13
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UBXN4-204ENST00000426921 MTHFSP49914 203 aa28.32■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.32■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.32■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.32■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 GNPATO15228 680 aa28.31■■■□□ 2.12
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UBXN4-204ENST00000426921 CABP4P57796 275 aa28.3■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
UBXN4-204ENST00000426921 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.29■■■□□ 2.12
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UBXN4-204ENST00000426921 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.23■■■□□ 2.11
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UBXN4-204ENST00000426921 TJP1Q07157 1748 aa28.21■■■□□ 2.11
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UBXN4-204ENST00000426921 C4AP0C0L4 1744 aa28.18■■■□□ 2.1
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UBXN4-204ENST00000426921 COL15A1P39059 1388 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.95■■■□□ 2.06
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UBXN4-204ENST00000426921 TEFQ10587 303 aa27.94■■■□□ 2.06
UBXN4-204ENST00000426921 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.94■■■□□ 2.06
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UBXN4-204ENST00000426921 A0A0G2JLW4 131 aa27.93■■■□□ 2.06
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