RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 GNRH1P01148 92 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC19A1P41440 591 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 NR3C2P08235 984 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 EPHA4P54764 986 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RNU6-564P-201ENST00000410983 A6NJY4 79 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 MTMR3Q13615 1198 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 HELQQ8TDG4 1101 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 MAPK1P28482 360 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 SMTNP53814 917 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 MTFR1Q15390 333 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ECM1Q16610 540 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 SPRYD7Q5W111 196 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 A0A1W2PRU2 124 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ALDH1A1P00352 501 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 IFFO2Q5TF58 517 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 XAGE2Q96GT9 111 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM13AO94988 1023 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARHGAP4P98171 946 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 FOXK2Q01167 660 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 NNTQ13423 1086 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBCELQ5QJ74 424 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 IL2RAP01589 272 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ADH1AP07327 375 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 C16orf46Q6P387 395 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 CNKSR1Q969H4 720 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 UNCXA6NJT0 531 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 NPR3P17342 541 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ASB16Q96NS5 453 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 CDK2AP1O14519 115 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 FOXC1Q12948 553 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 TLR1Q15399 786 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 CBLBQ13191 982 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 GIPC2Q8TF65 315 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 MPSTP25325 297 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 CLN3Q13286 438 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 PTGIRP43119 386 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 COX20Q5RI15 118 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 Q6ZVU0 165 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 NBPF15Q8N660 670 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 CENPCQ03188 943 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITPKCQ96DU7 683 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 NLRP3Q96P20 1036 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 USP3Q9Y6I4 520 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 SERTM1A2A2V5 107 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 MEN1O00255 615 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 AAMPQ13685 434 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 MYO19Q96H55 970 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 STIM2Q9P246 746 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-564P-201ENST00000410983 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms