RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.67■■□□□ 1.06
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USP25-204ENST00000400183 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.67■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 USP5P45974 858 aa21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 FERMT3Q86UX7 667 aa21.66■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 CFAP100Q494V2 611 aa21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.65■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.64■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.64■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.64■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.64■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.64■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.64■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 TOPBP1Q92547 1522 aa21.63■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 KIAA0754O94854 1291 aa21.63■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 MYD88Q99836 296 aa21.63■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 TAF4BQ92750 862 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 NAPBQ9H115 298 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 SYCE3A1L190 88 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 KIAA1328Q86T90 577 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 NAIPQ13075 1403 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 ANKRD62A6NC57 917 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 DESP17661 470 aa21.62■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 NESP48681 1621 aa21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 CENPHQ9H3R5 247 aa21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 WDR97A6NE52 1622 aa21.61■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.6■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.6■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 MAP3K12Q12852 859 aa21.6■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 CAMK4Q16566 473 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 NME9Q86XW9 330 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 ANO10Q9NW15 660 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 C8orf76Q96K31 380 aa21.59■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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USP25-204ENST00000400183 UBXN4Q92575 508 aa21.58■■□□□ 1.05
USP25-204ENST00000400183 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 ZPR1O75312 459 aa21.58■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.58■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 PIP4K2BP78356 416 aa21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 TNIP1Q15025 636 aa21.57■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 IQCA1Q86XH1 822 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 SKAP1Q86WV1 359 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 HYPKQ9NX55 129 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 F6X3S4 739 aa21.56■■□□□ 1.04
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USP25-204ENST00000400183 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.56■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 POTEJP0CG39 1038 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 TOP2BQ02880 1626 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 FAM193AP78312 1265 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 SLC5A1P13866 664 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 ZNF213O14771 459 aa21.54■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 SPA17Q15506 151 aa21.54■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.54■■□□□ 1.04
USP25-204ENST00000400183 CETN2P41208 172 aa21.54■■□□□ 1.04
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