RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 TRIM37O94972 964 aa21.61■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 NEUROD2Q15784 382 aa21.61■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 MCM10Q7L590 875 aa21.61■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 CABP4P57796 275 aa21.6■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 TEFQ10587 303 aa21.6■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 DCTN1Q14203 1278 aa21.59■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC125Q86Z20 511 aa21.59■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 PIGBQ92521 554 aa21.58■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 C5P01031 1676 aa21.58■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.58■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.58■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.57■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.57■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 TJP1Q07157 1748 aa21.57■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.56■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 26
C20orf27-204ENST00000399683 WWC1Q8IX03 1113 aa21.54■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 PALLDQ8WX93 1383 aa21.52■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.52■■□□□ 1.04
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF521Q96K83 1311 aa21.52■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.51■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 PLSCR1O15162 318 aa21.51■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 APBA3O96018 575 aa21.51■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 IL16Q14005 1332 aa21.51■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 BAG6P46379 1132 aa21.5■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 ATG3Q9NT62 314 aa21.5■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.5■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 BTBD11A6QL63 1104 aa21.49■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 WDR63Q8IWG1 891 aa21.49■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 IFT57Q9NWB7 429 aa21.49■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF790Q6PG37 636 aa21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 CFAP44Q96MT7 982 aa21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.48■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF853P0CG23 659 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 GNAI1P63096 354 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 C4BP0C0L5 1744 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 CHL1O00533 1208 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 SLC39A6Q13433 755 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf27-204ENST00000399683 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 CACNA1FO60840 1977 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 SIK1P57059 783 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.42■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.42■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.42■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.42■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 SOCS7O14512 581 aa21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 KCNQ3O43525 872 aa21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 TXNRD1Q16881 649 aa21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 MBIPQ9NS73 344 aa21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 GOLGA2Q08379 1002 aa21.4■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
C20orf27-204ENST00000399683 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 PROM2Q8N271 834 aa21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.39■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.38■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 E9PSI1 815 aa21.37■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 ATP6V1AP38606 617 aa21.37■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.37■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 C4AP0C0L4 1744 aa21.37■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 ITPK1Q13572 414 aa21.35■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 HOXB7P09629 217 aa21.34■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 SLFN5Q08AF3 891 aa21.34■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
C20orf27-204ENST00000399683 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.32■■□□□ 1
C20orf27-204ENST00000399683 KCNQ4P56696 695 aa21.32■■□□□ 1
C20orf27-204ENST00000399683 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.32■■□□□ 1
C20orf27-204ENST00000399683 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
C20orf27-204ENST00000399683 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.32■■□□□ 1
C20orf27-204ENST00000399683 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms