RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP53Q96M91 514 aa36.47■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 SMIM5Q71RC9 77 aa36.46■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.46■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.45■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 ITPK1Q13572 414 aa36.45■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 MSL1Q68DK7 614 aa36.44■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K5Q99683 1374 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHL34Q8N239 644 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 AK7Q96M32 723 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.41■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 HMOX1P09601 288 aa36.41■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP6V1AP38606 617 aa36.41■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.4■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.39■■■■□ 3.42
GNPTAB-202ENST00000392919 PHF14O94880 888 aa36.38■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 CABP4P57796 275 aa36.38■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC4A9Q96Q91 983 aa36.38■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 YY1P25490 414 aa36.37■■■■□ 3.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.33■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 NUDCQ9Y266 331 aa36.33■■■■□ 3.41
GNPTAB-202ENST00000392919 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 GNPATO15228 680 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 NLGN2Q8NFZ4 835 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 SSFA2P28290 1259 aa36.29■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 AKAP4Q5JQC9 854 aa36.29■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF831Q5JPB2 1677 aa36.28■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 LGR6Q9HBX8 967 aa36.27■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
GNPTAB-202ENST00000392919 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.23■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR162Q16538 588 aa36.21■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 RNMTO43148 476 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 ANP32CO43423 234 aa36.2■■■■□ 3.39
GNPTAB-202ENST00000392919 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC52A2Q9HAB3 445 aa36.19■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 PRKAR2BP31323 418 aa36.18■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 UTRNP46939 3433 aa36.17■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 FCHSD2O94868 740 aa36.17■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa36.16■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 TJP1Q07157 1748 aa36.16■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 MRC1P22897 1456 aa36.16■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC3LQ5T215 181 aa36.15■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa36.15■■■■□ 3.38
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
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GNPTAB-202ENST00000392919 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.13■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 RPS6KA4O75676 772 aa36.12■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC39A6Q13433 755 aa36.12■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 CHD4Q14839 1912 aa36.12■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 CRKLP46109 303 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
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GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC184Q52MB2 194 aa36.08■■■■□ 3.37
GNPTAB-202ENST00000392919 C4AP0C0L4 1744 aa36.06■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 ADRA2BP18089 450 aa36.06■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJC10Q8IXB1 793 aa36.06■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.06■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 KCPQ6ZWJ8 1503 aa36.05■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP10P09238 476 aa36.05■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.05■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 RFC4P35249 363 aa36.04■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 IL17REQ8NFR9 667 aa36.04■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 GYS1P13807 737 aa36.03■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.02■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 NLGN1Q8N2Q7 840 aa36.01■■■■□ 3.36
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
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GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.98■■■■□ 3.35
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
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GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.97■■■■□ 3.35
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GNPTAB-202ENST00000392919 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
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GNPTAB-202ENST00000392919 TEFQ10587 303 aa35.94■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 MRS2Q9HD23 443 aa35.93■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
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GNPTAB-202ENST00000392919 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.91■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.9■■■■□ 3.34
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