RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SEMA3FQ13275 785 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GNASQ5JWF2 1037 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGF1RP08069 1367 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RASSF7Q02833 373 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C4orf17Q53FE4 359 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MX2P20592 715 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PHKA2P46019 1235 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TLR1Q15399 786 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COG6Q9Y2V7 657 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GDF11O95390 407 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 INHAP05111 366 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 THBS1P07996 1170 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SCNN1DP51172 638 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GDF10P55107 478 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KANK3Q6NY19 840 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GPAMQ9HCL2 828 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PHF24Q9UPV7 400 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BCRP11274 1271 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MSX1P28360 303 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MAP2K3P46734 347 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WWC1Q8IX03 1113 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PGBD3Q8N328 593 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ACDQ96AP0 544 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IRS1P35568 1242 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EFHC2Q5JST6 749 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ALG2Q9H553 416 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RUBCNLQ9H714 662 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PIK3CDO00329 1044 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLA2G4AP47712 749 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMTNP53814 917 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FLIIQ13045 1269 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EML3Q32P44 896 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC4A9Q96Q91 983 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OIP5O43482 229 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RAD21O60216 631 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SKIP12755 728 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MTFR1Q15390 333 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KLRG1Q96E93 195 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 POM121Q96HA1 1249 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A6NJY4 79 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CDK2AP1O14519 115 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BACH1O14867 736 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PODNQ7Z5L7 613 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NLRP8Q86W28 1048 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NOD1Q9Y239 953 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BNIP3LO60238 219 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BMP4P12644 408 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATP4AP20648 1035 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FGFR3P22607 806 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GTF2IP78347 998 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FOXK2Q01167 660 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NCOA4Q13772 614 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NBPF1Q3BBV0 1214 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AIDAQ96BJ3 306 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1175P-201ENST00000365200 USP17L5A8MUK1 530 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms