RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 SOX11P35716 441 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP3K10Q02779 954 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-534P-201ENST00000364877 TLR1Q15399 786 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-534P-201ENST00000364877 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A1B0GTH6 734 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 C4orf17Q53FE4 359 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 WWC1Q8IX03 1113 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 IGF1RP08069 1367 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 ARHGEF15O94989 841 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 KCNMA1Q12791 1236 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 POM121Q96HA1 1249 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 PIK3CDO00329 1044 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 MX2P20592 715 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 SCNN1DP51172 638 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 GDF10P55107 478 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 PGBD3Q8N328 593 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 RAD21O60216 631 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 INHAP05111 366 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 THBS1P07996 1170 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLA2G4AP47712 749 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 RUBCNLQ9H714 662 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 SKIP12755 728 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 MSX1P28360 303 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 GSK3AP49840 483 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 RASSF7Q02833 373 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 EML3Q32P44 896 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 EFHC2Q5JST6 749 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 GDF11O95390 407 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 FLIIQ13045 1269 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACDQ96AP0 544 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 PHF24Q9UPV7 400 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-534P-201ENST00000364877 BCRP11274 1271 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 IRS1P35568 1242 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP2K3P46734 347 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMTNP53814 917 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 ALG2Q9H553 416 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NOD1Q9Y239 953 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 PSME1Q06323 249 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NCOA4Q13772 614 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 AIDAQ96BJ3 306 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 POM121CA8CG34 1229 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 GTF2IP78347 998 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP17L5A8MUK1 530 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 KANK3Q6NY19 840 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 A6NJY4 79 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 BACH1O14867 736 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATP4AP20648 1035 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 PODNQ7Z5L7 613 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 CABP1Q9NZU7 370 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP3Q9Y6I4 520 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 CDK2AP1O14519 115 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 BNIP3LO60238 219 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 BMP4P12644 408 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 FGFR3P22607 806 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 MTFR1Q15390 333 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 KLRG1Q96E93 195 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-534P-201ENST00000364877 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 OIP5O43482 229 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF358Q9NW07 568 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A1W2PNR3 127 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1248.4 ms